隨著科學技術和經濟的發展，還有其他行業熱錢的巨量進入，食用菌的工業化生產迅猛發展，隨著食用菌工業化、規模化的迅速發展帶動了不同規模和潔凈度級別的凈化車間（潔凈室）的應用和發展，對于食用菌行業來說，凈化車間是非常重要的生產場所，并且凈化車間在食用菌行業已經得到了廣泛的應用。但是由于凈化車間設計、維護、管理是需要專業知識的，有些公司缺乏相關的知識，導致了間凈化車間設計、維護、管理方面不能達到預期的效果。根據科學證明，凈化車間能否達到預期效果與凈化車間設計、選擇、裝修施工有密切的關系，并且與凈化車間（潔凈室）的正確使用和科學維護密不可分。
一、什么樣的車間才是食用菌凈化車間
凈化車間是指，經過凈化車間設計，要將一定空間范圍內的空氣中的塵粒、微生物、有害氣體等污染物進行過濾和阻隔，并且要把室內的潔凈度、溫度、濕度、照明度、氣壓、氣流速度、氣流分布、以及噪音等控制在某一需求范圍，而所給予特別設計的房間。只有符合凈化車間的定義標準的食用菌生產車間才是真正意義上的凈化車間。
二、食用菌凈化車間等級標準
對于食用菌凈化車間設計來說，食用菌凈化車間的等級標準是參考國家凈化標準的。潔凈等級是根據潔凈空間單位體積空氣中，以大于或等于被考慮粒徑的粒子最大濃度限值進行劃分的等級標準（圖1）。
凈化車間設計要注重科學設計。在食用菌生產中一般把接種室設計成萬級，接種間內配套超凈工作臺或層流罩進行接種。其它輔助車間如冷卻室、人流物流通道等設計成十萬級。