食品工廠設計方案經過技術經濟分析后就進入決策階段。所謂決策，就是在各個方案中選擇最佳方案。為避免在決策中發生重大、根本性的錯誤，我們必須先對方案進行綜合分析，而后再根據一定的原則進行。
一、食品工廠設計方案的綜合分析
方案的綜合分析，就是將每個方案在技術、經濟上的各種指標、優缺點全面列出，以作為方案評價和選擇時的分析依據。方案的綜合分析一般包括以下內容：
(1)列出和分析每個方案的計算經濟影響指標。任何一個技術方案，它的投資效果系數和投資利潤都應高于國家或部門規定的標準數據。若項目的投資是在有償使用的條件下，投資效果系數和投資利潤率一定要高于銀行貸款的利率，否則，在項目建成后，連利息都付不起，這樣的項目是不能投資和建設的
（2）列出各方案總投資、單位投資和產品投資率，分析投資構成和投資水平的原因，提出減少投資的方向和具體措施。在分析投資時，特別要注意結合項目技術特點，嚴格分清項目建設及逐年所需的投資額，避免投資積壓，盡量提高投資的使用效果。
(3)列出并分析了各方案的生產成本、分析成本的組成及影響因素，提出了降低成本的原則和主要途徑。
（4）列出并分析每一方案實施后產品的數量和質量，指出這些產品對發展食品工業、提高人民生活水平和發展農業，特別是出口產品的意義，體現國際競爭力。
(5)分析了各項目投入生產后的勞動生產率，與同類企業相比，國內、國際水平高、低，如何提高生產效率等。
（6）分析各方案采用了哪些先進技術，其水平和成熟度如何，這些先進技術對提高產品質量和勞動生產率有何影響，經濟效益如何。
(7)列出并分析各方案在消耗重要物資和擁有農業用地方面的情況，并說明采取了哪些措施。
（8）分析每個方案的建設周期，提出保證工程質量、縮短工期的措施。
（9）分析項目的“三廢”處理情況。
在進行每個方案的綜合分析時，要有科學態度，有敘述、有評論，為正確合理地選擇方案提供依據。
二、食品工廠設計方案選擇的原則
正確、合理地選擇規劃，將為地區和企業的經濟繁榮打下堅實的基礎，而方案的選擇是十分困難和復雜的。通常，在選擇時，彼此面對的各種方案常常是矛盾的并且具有長和短的長度。為了做出正確的決策，我們應該根據項目的特點和以下原則選擇最佳方案。
（1）食品工廠建設計劃的選擇，有充足的原材料和市場需求，將考慮經濟效益。
（2）方案的選擇要符合國情和地區實際情況例如根據我國能源緊張和勞動力比較富裕的國情特點，在選擇進口先進設備時就要具體分析，切勿盲目引進，給國家、地方或企業造成不必要的經濟損失。
（3）方案的選擇要與方案的實施相結合，選擇的方案雖經濟效果最好，如實施有困難，則仍是紙上談兵。在方案選擇時，不可忽視方案實施的可能性
（4）在選擇方案時，要聽取不同意見，盡量避免片面性，使方案選擇更加合理。這樣，當食品工廠投產后，就可獲得較好的經濟效益和社會效益。