“安全為了生產，生產必須安全”，這是處理生產和安全之間關系的基本準則。盲目追求經濟效益，而置安全隱患于不顧，極有可能發生火災、爆炸和人身傷亡等事故。為保證生產安全，醫藥廠房設計人員應按照有關設計規范和規定的要求，首先從廠房結構上下工夫。其次是采取措施杜絕各種火源，如杜絕各種明火、選用防爆電氣設備、設置防雷和抗靜電裝置、防止摩擦和撞擊火花等。最后，應設置完善的消防設施。從而為工程項目的試產和正常生產創造必要的安全條件，并設置萬一發生事故時所需的應急設施。
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一、醫藥廠房的防爆設計
有爆炸危險的醫藥廠房，一旦發生爆炸，往往會造成嚴重的人員傷亡和財產損失，如果處理不當，還會影響到相鄰廠房的安全。因此做好廠房的防爆設計，對預防爆炸和減少爆炸時的人員傷亡及財產損失，具有非常重要的意義。
1、合理選型和布置
有爆炸危險的醫藥廠房宜采用矩形，并與當地的常年主導風向垂直布置，以充分利用穿堂風吹散爆炸性氣體或粉塵。有爆炸危險的廠房宜采用單層，必須采用多層時應置于最上層。有爆炸危險的生產設備應布置在外墻門窗附近，有火源的配電間、化驗室、辦公室等應集中布置在廠房的一端并用防火墻與生產區分隔開來。
2、采用防爆結構
有爆炸危險的醫藥廠房，其結構選型是非常重要的。選用耐火性能好、抗爆能力強的結構型式，在萬一發生爆炸時，可避免廠房的倒塌破壞。雖然鋼結構的耐爆強度很高，但其耐火極限較差。當發生火災爆炸時，鋼結構會因高溫變形而倒塌。實踐證明，采用現澆鋼筋混凝土框架防爆結構的廠房，在爆炸時可避免發生倒塌破壞；而采用承重墻結構的廠房，在爆炸時大多發生倒塌破壞。因此，為避免爆炸時發生倒塌破壞，有爆炸危險的廠房宜采用鋼筋混凝土框架防爆結構。
3、設置泄壓面積
有爆炸危險的廠房，應設置必要的泄壓面積。設置的泄壓面積越大，爆炸時的室內壓力就越小，建筑結構遭受破壞的程度就越輕。我國的設計規范規定，對有爆炸危險的廠房，泄壓面積與廠房體積的比值采用0.05～0.10m2·m-3。
有爆炸危險的醫藥廠房，應盡可能采用敞開式或半敞開式結構，這樣既能防止爆炸性氣體或粉塵的積聚，又能保證有足夠的泄壓面積。當有爆炸危險的廠房必須采用封閉式結構時，應在靠近可能爆炸的部位設置輕質屋頂、輕質墻體和門窗等泄壓設施。由于泄壓設施的耐壓能力較差，因此，爆炸時將首先爆破而向外釋放出大量的氣體和熱量，使室內的爆炸壓力迅速下降，從而使承重結構免遭倒塌破壞。
泄壓面積的布置要合理，泄壓方向宜向上空，并盡量避免朝向人員集中的地方或交通要道。當泄壓設施有可能影響到鄰近車間或建筑物的安全時，應在泄壓設施外設置保護擋板。
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4、設置安全出口
醫藥廠房在發生爆炸前，一般都會有一些不正常現象，如化學反應加劇、冒濃煙和發出異常聲響等，過一會兒才發生爆炸，即在爆炸發生前存在一定的“允許疏散時間”雖然允許疏散時間很短，一般只有幾分鐘，但若廠房有足夠數量的符合要求的安全出口，工作人員就有可能在爆炸發生前跑出廠房。廠房外墻上設置的外開門、封閉式樓梯間以及有防火墻或防爆墻分隔的室外樓梯，均可作為安全出口。工作人員能否在允許疏散時間內撤出廠房，主要取決于安全出口的數量、寬度以及工作地點距安全出口的距離。
有爆炸危險的廠房，其安全出口的數量應不少于兩個。這是因為當一個出口被火或濃煙封死后，至少還有一個出口可供人員疏散，從而可避免更嚴重的傷亡。
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二、醫藥廠房的防爆措施
生產過程中的明火主要是指生產過程中的加熱用火、維修用火和其他火源。有火災或爆炸危險的廠房內，不得使用電爐、煤氣爐等明火加熱。任何人都不得攜帶火柴、打火機等火種進入有火災或爆炸危險的廠房，更不得在其中吸煙。應盡量避免在有火災或爆炸危險的廠房內進行割焊操作，需檢修的設備或管段應盡可能拆卸至安全地點修理，必須在現場進行割焊修理的要嚴格執行動火安全規定。
此外，汽車、拖拉機、柴油機等的排氣管噴火，也有可能引起火災或爆炸。因此，出入有火災或爆炸危險區域的汽車、拖拉機、柴油機等必須采取相應的安全措施，其排氣管出口必須安裝消火器。