對于藥廠設(shè)計來說，根據(jù)各潔凈系統(tǒng)的運行經(jīng)驗可知，潔凈室的能耗遠高于一般辦公樓的能源耗量，而且隨著科學(xué)技術(shù)的進步，新產(chǎn)品的研制及各種藥品對潔凈系統(tǒng)潔凈度的要求日益提高。空氣潔凈技術(shù)面對這種挑戰(zhàn)，如果不采取新的對策一革新的藥廠設(shè)計方法、研制新式節(jié)能設(shè)備、提高運行管理水平，則將無法滿足生產(chǎn)上的要求，或者在能源消耗上要付出更高的代價。所以各國對現(xiàn)代潔凈室的建筑，無不從藥廠設(shè)計、運行管理、研究開發(fā)方面考慮各種手段、措施來減少能耗，而且凈化產(chǎn)品的制造廠商也千方百計地開拓新的產(chǎn)品，以滿足技術(shù)發(fā)展的需求。
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1.廠址選擇、建筑布局與工藝設(shè)置的合理性，可以從根本上降低初投資及運行費用。
2.減少凈化空間是大家共同關(guān)注的實現(xiàn)節(jié)能的快捷有效途徑的方向。凈化系統(tǒng)的風(fēng)量取決于房間體積和換氣次數(shù)，而換氣次數(shù)大多由潔凈級別所確定，因此要降低潔凈系統(tǒng)的風(fēng)量可從減小凈化空間入手。因為低風(fēng)量化即合理地選定換氣次數(shù)可以減少送風(fēng)動力消耗。同時在管路設(shè)計中盡可能減少系統(tǒng)的阻力，也可達到降低送風(fēng)動力消耗的效果。
3.正確確定生產(chǎn)設(shè)備的熱負荷對選定空調(diào)制冷設(shè)備有直接關(guān)系。
4.空調(diào)和凈化功能的分離有利于發(fā)揮各自的技術(shù)經(jīng)濟合理性。
5.工藝過程和空調(diào)系統(tǒng)的熱回收是可以直接獲益的措施，因此應(yīng)充分利用這部分熱量，使之達到物盡其用的目的。
6.藥廠設(shè)計方案應(yīng)具有較好的適應(yīng)性（靈活性），它是實驗性車間必須考慮的問題（如單向流/單向流的轉(zhuǎn)換、分區(qū)轉(zhuǎn)換等）。
7.新風(fēng)集中處理有利于應(yīng)用地下水預(yù)冷、除塵和加濕。
8.室內(nèi)換氣次數(shù)和末級過濾器效率之間的組合（達到相同級別）需進行經(jīng)濟比較。