做好潔凈室內工作人員的衛生和健康可減少潔凈室內人源顆粒物和纖維的污染。以下指導方針適用于各種級別的潔凈室，對于ISO5級及更高級別尤其重要。進行風險鑒定并確定如何處理每種情況對潔凈室內的產品和工藝的整體質量和產量十分重要。
1、個人因素
在潔凈室內工作的人員應每日洗浴，防止身體上積聚油脂、鹽、污垢和細菌。這些物質都是潔凈室內的潛在污染物。頭發既吸附粒子，又脫落粒子，應該將頭發剪到可控制的長度，并整潔地夾起來或別起來，任何時候頭發不能外露。應該每日或經常洗頭。手指甲應該剪短，防止指甲損壞清潔手套。潔凈室工作人員不應使用化妝品、油脂類潤膚液、發型噴霧和指甲油，這些物質都有污染性。
2、疾病
頻繁的咳嗽、打噴嚏、流鼻涕等現象會影響潔凈室內工作人員的表現，還可能污染環境。表現出任何上述癥狀的人員在痊愈之前都不應在潔凈室內工作。潔凈室的密閉環境可能會導致昏暈或幽閉恐懼癥。有這些癥狀的人員會感到在潔凈室內工作非常不舒服。這些情況可能還會產生安全方面的問題。應將無此類情況列為聘用條件之一，以便在員工受聘時未暴露或不知道自己有這類癥狀時給予幫助。
3、皮膚情況
因身體狀況產生皮屑會給潔凈室帶來污染，應將無這種情況列為聘用條件之一。如果工人對某服裝或附件（如乳膠手套）過敏，應提供其他替代材料制成的物品。
4、呼吸問題
潔凈室人員因感冒或季節性過敏而咳嗽或打噴嚏時，應告知監管人員。此時要確定使用口罩或面罩是否足以對潔凈室內產品或工藝的威脅，或是否有必要面臨時分派潔凈室外的其他工作。進入潔凈室前至少30min內禁止吸煙，這樣才可以從肺部和嘴中清楚殘余的煙草顆粒物。此外，吸煙的人要用水漱口，并吞咽幾次才可進入潔凈室。