凈化空調(diào)系統(tǒng)的空調(diào)箱內(nèi)壁材料應(yīng)不易產(chǎn)生灰塵并耐腐蝕，生物凈化空調(diào)系統(tǒng)所用的空調(diào)箱內(nèi)壁要可以消毒。
凈化空調(diào)系統(tǒng)空調(diào)箱功能段數(shù)要多于普通空調(diào)系統(tǒng)，而且維護(hù)保養(yǎng)的要求也比較高，例如初、中效過濾器要經(jīng)常更換，空調(diào)箱內(nèi)壁要清潔、消毒，所以空調(diào)箱的長度也比普通空調(diào)系統(tǒng)的空調(diào)箱長。為了節(jié)省空調(diào)機(jī)房的面積，在滿足使用功能的前提下，應(yīng)盡可能使結(jié)構(gòu)緊湊。
凈化空調(diào)系統(tǒng)中化學(xué)過濾器應(yīng)根據(jù)生產(chǎn)過程中所產(chǎn)生廢氣的性質(zhì)和廢氣的量來確定化學(xué)過濾的種類，防止?jié)崈艨諝庋h(huán)次數(shù)多而使廢氣的濃度越來越高。潔凈空調(diào)箱在新風(fēng)入口段是否要設(shè)置化學(xué)過濾器，要根據(jù)工程所在地的大氣環(huán)境來決定。如電子廠房設(shè)置在海邊，海水蒸發(fā)會使空氣中的氯、鈉離子數(shù)量增加。若不作處理，離子進(jìn)入潔凈室會對產(chǎn)品造成影響，就應(yīng)該在新風(fēng)入口處設(shè)置化學(xué)過濾器。
凈化空調(diào)系統(tǒng)選用空調(diào)箱風(fēng)機(jī)時要考慮到凈化空調(diào)系統(tǒng)的風(fēng)阻力比一般空調(diào)系統(tǒng)要大，因?yàn)橛谐酢⒅小⒏咝夁^濾而且阻力變化也很大。初、中、高效三級過濾器從初阻力一直到終阻力的阻力疊加數(shù)值占整個凈化空調(diào)系統(tǒng)總阻力的比例很大，因此空調(diào)箱應(yīng)該選用變頻風(fēng)機(jī)，這里選用變頻風(fēng)機(jī)不是為了改變潔凈系統(tǒng)的送風(fēng)量，而是為了適應(yīng)初、中、高效過濾器的阻力變化。全新風(fēng)凈化空調(diào)系統(tǒng)中，若因工藝發(fā)生變化造成排風(fēng)量的變化，為了保持室內(nèi)的正壓值不變，可以通過送風(fēng)機(jī)的變頻來相應(yīng)改變送風(fēng)量。
空調(diào)箱表冷器進(jìn)出水水溫的確定取決于凈化空調(diào)系統(tǒng)的送風(fēng)狀態(tài)的溫濕度參數(shù)。由于生產(chǎn)工藝對室內(nèi)溫濕度的要求不同，再加上凈化空調(diào)系統(tǒng)的送風(fēng)量往往不是由負(fù)荷大小來決定而是根據(jù)潔凈度級別來決定的，送風(fēng)量大送風(fēng)溫差就小，潔凈室內(nèi)的溫度基數(shù)低送風(fēng)溫度就低。根據(jù)一般經(jīng)驗(yàn)，表冷器的進(jìn)水溫度要比送風(fēng)狀態(tài)溫度低3～6℃，表冷器的出水溫度要比送風(fēng)狀態(tài)溫度低0.5～1℃，這完全取決于潔凈室內(nèi)的設(shè)計溫度基數(shù)和冷媒水進(jìn)表冷器的溫度（一般就是6～7℃）以及表冷器性能的各個參數(shù)，如接觸系數(shù)、表冷器的排數(shù)、析濕系數(shù)、傳熱系數(shù)、水流速、換熱效率系數(shù)等。